脂溢性皮炎与毛囊炎相比，从发病原因、临床症状到后期的治疗都有明显区别。
从发病原因角度，脂溢性皮炎本身是因为休息不好、睡眠不足、精神压力大等因素，导致头皮或者是颜面部位的皮脂分泌过多而引发，会导致皮肤干燥、皮屑增多；而毛囊炎则主要是因为毛囊口堵塞，内部滋生的一些细菌而导致的，可能与熬夜有关。
两种疾病从临床症状上，脂溢性皮炎主要以干燥皮屑和轻度的瘙痒为主，而毛囊炎则主要以突起于皮肤的炎性丘疹或白色的脓头为主，伴随着按压性的疼痛。
在治疗方面，脂溢性皮炎建议口服维生素b族，而毛囊炎则建议口服抗生素。