CT能够检查出绝大部分的肾结石。对肾结石是比较敏感的，不但能够判断出肾结石的大小、形态、部位，还能够判断出是否引起了尿路梗阻。
但是也有一部分肾结石，CT上是不能够显示的，又称之为阴性肾结石，这与肾结石的成分是有关系的。虽然CT能够检查出大部分的肾结石，但是一般肾结石并不会选择CT作为首选的影像学检查方式，而是会选择超声。
超声对肾结石也是比较敏感的，怀疑有肾结石的患者会首选一个超声检查，如果超声并没有看到，可以选择CT作为补充的检查方式。