在进行肛门指诊，肛门镜检查，结肠镜检查，直肠镜检查及各种灌肠治疗时，必须使用肛门润滑剂。
因为上述检查及治疗均属于侵入性操作，肛门括约肌正常的生理性反射是紧缩状态，这样可以达到自我保护的目的。这时如果强行进行检查及治疗操作，可能会导致皮肤及肌肉组织的损伤，患者会因为剧烈疼痛及流血而恐惧并拒绝配合检查或治疗。
所以在检查治疗前，应充分将肛门润滑剂将手指，检查器械及管道充分的润滑，尽量避免对肛管及肠道粘膜的损伤，将患者的疼痛及不适感降到最低，才可能顺利完成检查或治疗。