婴儿长期性的消化不良的原因一般有两种：
一、因为家长经常性给孩子食用难以消化的食物。
二、因为孩子脾胃虚寒所导致的。
生活中家长可能会因为习惯性以及其他的原因，经常性给孩子食用营养含量或者是蛋白质含量过高的食物，这种情况下，可能会导致孩子脾胃难以消化的现象。孩子本身脾胃发育还不是特别的完全，这个时候如果再因为经常性的食用难以消化的食物，会导致脾胃虚寒，从而也就造成了孩子出现习惯性的消化不良现象。
消化不良现象是十分影响孩子身体的正常发育的，因此在生活中，家长应注意避免给孩子食用过多难以消化的食物。并且严重的消化不良患者，应配合相应的益生菌类药物进行治疗。