结膜炎的治疗多以口服性抗炎药物结合局部眼药水点眼治疗，而具体的用药还需根据患者所患结膜炎的类型、病情的轻重、发病的症状等情况综合判断。
例如，细菌性结膜炎患者，在治疗方面，可以选择红霉素类口服药物联合喹诺酮类眼药水点眼治疗，也可以视情况进行局部的物理方式干预。
而过敏性结膜炎，大多可通过抗组胺类、非甾体抗炎类全身性口服药物结合局部眼药水治疗。结膜炎的类型很多，用药各有不同，建议患者在医生的指导下用药治疗。