清洁灌肠时肛管插管的深度大约为成人7-10公分，儿童4-7公分左右。
人体解剖平均肛管长度约为3-4公分，直肠的长度约为10-14公分，而在进行清洁灌肠时，无需保留灌肠液。因此教科书上要求的成人灌肠插管的深度约7-10公分，就可以将灌肠液送至直肠壶腹到乙状结肠。
但临床上操作时发现灌肠液聚集到直肠壶腹后，刺激直肠壁产生排便反射，而将灌肠液排出，清洁灌肠的效果相对较差。因此在插管顺利和允许的情况下，插管深度在15公分-20公分时，清洁灌肠的效果更佳。