戒烟了以后反而咳嗽，主要有以下原因：
一方面，由于患者长时间吸烟造成了肺部的慢性疾病。比如造成慢性支气管炎、肺气肿、慢性阻塞性肺疾病、支气管肺癌。虽然停止吸烟以后，但是这些疾病依然存在，依然对肺部造成损害，甚至会出现不断地进展。所以，患者虽然戒了烟，还会出现不断的咳嗽。
另一方面，吸烟的患者由于吸烟时间过长，导致烟雾中的毒素残留于肺内，当患者戒烟以后，需要一个长期的排除烟毒的过程。这个过程可能1~2个月，有的患者甚至半年到1年以上，这也是引起患者戒烟以后咳嗽的原因。