病毒性咽峡炎主要是病毒感染所引发，柯萨奇病毒、肠道病毒以及埃可病毒，都有可能导致此病发生。
病毒传播的主要途径，是通过呼吸道的飞沫传播或者是饮食上的肠道传播，以及手部或者是衣物等接触到了病毒感染之后造成的间接传染所导致。
病毒性咽峡炎的患病人群多数为儿童，这是由于儿童本身身体的免疫力较差，呼吸道的屏障功能发育还不完善，抵御外界病毒入侵的免疫功能不足所造成。大多数的病毒性咽峡炎具有自限性，不需要特殊服用药物即可痊愈。