不由自主地摇头多考虑可能是以下两种疾病所引起：
一种疾病可能为特发性震颤，患者主要表现为局部肌肉不由自主地震颤，通常为有节律性的姿势性震颤，往往会累及患者的上肢或头部，表现为摇头或肢体震颤。该病的发病原因尚不明确，多考虑为基因突变所引起，疾病进展较为缓慢，通常不会对人的寿命造成影响。
另一种疾病可能为神经性的抽动症疾病所引起，通常在身体过度劳累，精神受到强烈刺激或情绪极度紧张的情况下出现，可能为神经官能症的表现，也可能为其他神经因素所引起的不由自主的肌肉震颤。如果不由自主的摇头现象持续不能缓解，应及时就诊，明确病因后，对症治疗。