房颤的球囊冷冻消融术也有一定的副作用，主要包括以下几种：
第一，隔神经的麻痹。
第二，肺静脉狭窄。
第三，动静脉瘘。
第四，食道左房瘘。
第五，心包填塞。
房颤的冷冻球囊消融术是近几年在临床上开展的一种微创手术，它的优点是创伤小、恢复快，而且复发率低，特别适合阵发性房颤的治疗，效果最好。但是和其它的手术一样，也有一定的副作用。在手术的操作过程中，由于操作不当或者其它的原因，也会出现一些并发症。所以在治疗的各个环节都要认真细致，尽量减少并发症的发生。