蛋白尿的增多是肾病综合征最重要的临床特点，治疗肾病综合征的蛋白尿，是需要结合患者的临床类型和病理类型。
原发性的肾病综合征，通常是需要使用足量的糖皮质激素进行治疗。在有些病理类型引起的肾病综合征，比如膜性肾病，往往还需要联合使用免疫抑制剂环磷酰胺，或者环孢素等。在这样的基础之上，还可以使用肾素血管紧张素阻断剂，如贝那普利，可以起到协同降低尿蛋白、保护肾功能的作用。
如果是糖尿病肾病引起的肾病综合征，往往还需要使用降糖的药物。而由于乙肝病毒感染引起的肾病综合征，主要是使用抗乙肝病毒的治疗。