矮小症通常不会导致性早熟，相反的是性早熟容易出现矮小的情况。一些内分泌的矮小症可能会伴随有性早熟，比方甲减的情况，但是单纯性的矮小症一般不会出现性早熟。
性早熟由于骨骼的过早成熟，骨骺闭合，而且出现的性征发育的过早出现，都会导致身体最终身高的矮小。所以，性早熟出现矮小的情况是由于性征发育过早出现而导致。
矮小症的孩子大多数是由于生长激素分泌不足所导致的身高比正常儿童低两个标准差，而且每年的生长速率会小于五公分的情况，和性早熟是有一定区别的。