亚急性甲状腺炎在甲减期不同患者因为病情发展不同，临床表现可能略微不同。
绝大多数亚急性甲状腺炎的病史过程，是因为甲状腺破坏所产生甲状腺毒症，表现为甲亢的表现。之后随着破坏加重，会逐渐出现甲状腺功能减退的激素改变。如果持续时间较长，会出现明显甲减症状，病人表现为乏力、畏寒、食欲减退、记忆力下降等。
另一部分患者由于治疗比较及时，或病情本身特点甲状腺破坏不严重，在很短时间内甲状腺功能由甲状腺毒症，变为甲状腺功能正常，中间的甲状腺功能减退时间很短，从而没有明显临床甲减症状，只是表现为原有的心慌、乏力、出汗等症状明显减轻。