孕早期褐色分泌物有可能是先兆流产、胚胎发育不良、宫颈出血或者宫外孕、葡萄胎等，都有可能引起怀孕早期的出血。
出现出血的情况，首先应该去医院检查，看是否宫内孕。如果宫内孕，要考虑胚胎发育不良或先兆流产可能。如果先兆流产，可以应用药物保胎治疗。如果胚胎停育，应用保胎药物是无效的。除了做B超，还应该检查HCG，如果HCG异常增高，要考虑葡萄胎的可能性。
如果是宫颈息肉或宫颈病变，也有可能会引起宫颈出血，必要时可以做宫颈防癌筛查。