肛周脓肿是因为便秘引起的。
各种原因引起的便秘，造成大便在肠管中长时间停留，粪便中的水分被肠壁长时间过量地吸收，造成了大便干燥、质地坚硬，随着肠蠕动很容易造成了肠黏膜的损伤，诱发感染。同时，肛隐窝开口向上，容易兜积粪便，粪便的堆积造成了肛门腺分泌外口受阻，细菌从肛门腺导管逆行侵入，可引起肛隐窝炎症，使肛腺管水肿阻塞引起肛腺发炎，形成了肛管直肠周围炎。
炎症继续发展，感染化脓，则形成了内外括约肌间脓肿，脓肿可沿着肛门括约肌各层的间隙蔓延，形成不同脓肿。