肛窦炎不是终身病，经过保守治疗和手术治疗可以治愈。
肛窦炎是肛窦和肛门瓣，发生的急慢性炎症。肛窦炎会引起许多肛周疾病，如肛周脓肿、肛瘘、肛乳头炎等。积极治疗肛窦炎，对预防肛周疾病的发生，有积极的作用。得了肛周炎，首先要保守治疗，可口服抗感染药物、肛门熏洗坐浴、外用痔疮膏、痔疮栓纳肛、肛门微波理疗等。
如果经过药物等保守治疗无效，肛窦内已化脓，或伴有肛乳头肥大、皮下瘘，要进行手术治疗。