乳腺囊肿应该与乳腺纤维腺瘤、乳腺小叶增生、乳腺癌相互鉴别。
1、乳腺囊肿常常以单侧多见，呈圆形或椭圆形，边界清楚，活动度好，质地偏软，囊肿随月经周期的改变而逐渐增大。
2、乳腺纤维腺瘤肿块大多为单侧单发，肿块多为圆形或卵圆形，边界清楚，活动度好，但一般没有乳房胀痛，乳房肿块的大小性状也不随月经周期而发生变化。
3、乳腺小叶增生病常为多发性，肿块为颗粒状结节，与皮肤和深部组织并无粘连，病人常有不同程度的乳房胀痛，胀痛与月经周期有关。
4、而乳腺癌肿块质地比较偏硬，肿块大多为单发，易于皮肤及周围组织发生粘连，肿块与月经周期及情绪变化无关。