淋巴结副球孢子菌病的治疗方法是进行抗感染、抗副球孢子菌药物治疗为主，通常选择伊曲康唑、氟康唑等抗真菌药物治疗。
当发生全身性炎症反应，如高热时，可以口服抗生素，如头孢菌素类药物进行抗炎治疗。淋巴结副球孢子菌病经正规治疗后，可消除病原菌，预后较好，不会影响患者生活质量和寿命长短。
在日常生活中要注意，服用药物时，如果出现恶心、呕吐等不良现象时，要及时和医生沟通，更换药物种类或停止药物的使用。要定期复查进行、加强营养、适当运动、增强身体免疫力。
在日常生活中，尤其是在中南美洲地区生活或旅游的人以及咖啡豆工人，要定期体检。发生身体变化时，及早治疗，可以有效减少淋巴结副球孢子菌病的发生。