卵巢激素分泌异常，一般来说并不会导致巧克力囊肿。
卵巢激素分泌异常，有可能会导致月经紊乱、月经异常，也会导致一些卵巢肿瘤，比如颗粒细胞瘤，还有一些卵巢的恶性肿瘤，但是一般来说不会导致卵巢巧克力囊肿。
卵巢巧克力囊肿是一种子宫内膜异位症，是因为子宫内膜异位到卵巢上，在卵巢内生长，随着月经周期而发生变化，跟经血逆流有关，比如经期同房、经期盆浴，还有经期剧烈运动，或者一些宫腔的操作，或者生殖道异常导致经血排出受阻等等有关。卵巢巧克力囊肿会影响卵巢的功能，会影响卵巢激素的分泌。