门静脉高压症一般不会遗传，但是如果是遗传代谢性肝病导致的门静脉高压可能会遗传。
门静脉高压症大部分是肝硬化引起的，而肝硬化本身是不遗传的。但是患者如果是肝炎病毒引起的肝硬化，比如乙肝、丙肝相关的肝硬化，这类女性患者有可能在生孩子时将肝炎病毒传染给子女。子女如果感染了肝炎病毒，不及时治疗时可能也会进展至肝硬化失代偿期，出现门静脉高压的表现。
此外如果是肝豆状核变性、血色病等，这类疾病可能会遗传给孩子。如果进展至肝硬化失代偿期也会出现门静脉高压症，因此建议这类患者在怀孕时做好相关的基因检测。