胰腺囊腺癌的具体发病原因不详，可能和各种慢性刺激有关。
有些患者长期大量的饮酒，酒精本身会对人体的消化系统造成刺激，而且饮酒后会导致短时间内胰液的分泌明显增多，可能会对胰腺造成一定程度的损伤，长期慢性持续性的损伤，有可能诱发胰腺囊腺癌的发生。有些发生胰腺囊腺癌的患者有长期吸烟的习惯，吸烟也有可能诱发胰腺发生癌变。
有些患者存在慢性的胰腺炎，胰腺的慢性炎症也会对胰腺造成持续性的刺激，也有诱发胰腺癌变的风险。