扁桃体是人体的免疫器官，具有一定的免疫功能，含有各种吞噬细胞、以及T淋巴细胞、B淋巴细胞、免疫球蛋白。对从血液、淋巴或其他组织侵入机体的有害物质具有积极的防御作用。对于3到5岁儿童来说，轻中度的扁桃体肿大是一种常见现象，为了保持局部免疫功能，一般不考虑切除扁桃体。
但如果到了6到8岁之后，有以下情况时，需要切除扁桃体：每年有3到4次的急性扁桃体炎发作，反复发作病史超过两年；有两次以上的扁桃体周围脓肿；扁桃体过度肥大堵塞鼻咽部，导致呼吸不通畅、睡觉打呼噜；慢性扁桃体炎可能成为风湿性心脏病或者肾炎等疾病的潜在病灶；以及扁桃体角化症、扁桃体良性肿瘤等。