深呼吸就咳嗽是由于气道黏膜炎症引起的。深呼吸就咳嗽常见于气管炎、支气管炎或肺炎等。主要与细菌、病毒、支原体感染等有关系。由于感染使气道黏膜充血、水肿、反应性增高，深呼吸时可引起咳嗽。因此，如果是细菌感染引起的咳嗽，要及时使用广谱抗生素治疗，如头孢克肟、阿莫西林克拉维酸钾等。
如果是病毒感染引起的咳嗽，可以口服抗病毒药物治疗，如奥司他韦、阿昔洛韦片。
如果是支原体感染引起的咳嗽，可以使用阿奇霉素、红霉素治疗。同时给予止咳药物治疗，如肺力咳合剂、复方甘草片等。