法洛氏三联症主要的病因就是因为在孕妇怀孕过程中，由于使用了某些药物或者出现了宫腔内的病毒感染，影响到了胎儿的生长发育，使患者心脏发育出现了畸形。
特别是肺动脉发育出现了异常，导致肺动脉狭窄。由于肺动脉狭窄，导致了右心室的射血阻力增大，引起右心室肥大。实际上右心室肥大就是由于肺动脉狭窄造成的，所以主要的病变还是肺动脉狭窄。
因此，在怀孕期间要尽量减少药物的使用。再就是通过增加营养，增加身体的抵抗力，减少病毒感染的机会。对已经发生的法洛氏三联症，在出生以后要尽早通过手术治疗。