卵泡囊肿通常都可以治好，而且很多女性不用治疗就可以自然的缓解。
因为卵泡囊肿是属于生理性的囊肿，考虑可能是由于卵子排出来以后，卵泡液自然的淤积，又受到体内激素的刺激，从而形成的囊肿。在月经来潮以后，体内的激素水平会下降，所以卵泡囊肿就自然的萎缩消失，通常不会对身体造成不良的影响。
只是对于不能正常排卵，又出现卵泡囊肿的女性，在有生育要求的情况下，可能需要肌注尿促性腺激素来促进卵泡的破裂、排出，这样才可能怀孕。大多数的卵泡囊肿一般在三厘米左右。