甲状旁腺显像的副作用首先会对人体造成一定的辐射，由于需要应用同位素进行显像，具有一定的放射性，特别是对婴幼儿和孕妇的伤害最大，容易导致婴幼儿发育迟缓、孕妇流产、死胎等。另外，对于一些心肺功能不好的人群，也会导致病情加重，诱发危险。
甲状旁腺显像可以对甲状旁腺是否发生病变、肿大等做出诊断，为患者的治疗做出依据。鉴于存在一定的副作用，患者在检查时要根据自己的实际情况及医生的诊断来选择，特别是婴幼儿及备孕女性、孕妇等特殊人群，尽量地要避免对自身造成伤害。