肺炎会引起咳嗽，是因为入侵人体的病原体会刺激患者的呼吸道，而导致呼吸道黏膜功能受损，支气管、气管会发生收缩，所以当患者吸入空气后引起咳嗽。并且此时支气管、气管的黏膜活动会受到限制，这样很多异物，如痰液，会在这些地方聚积，进一步刺激呼吸道引起咳嗽。
正常人的呼吸道上的黏膜会自动筛除，并杀灭对人体不利的病原体来保护肺部。
除此之外呼吸道还会对冷空气进行加热，从而保证肺部正常功能，这样肺部就可以进行高效率的气体交换，保证呼吸道通畅。所以当呼吸道受损时，吸入冷空气也会引起咳嗽。