得了无菌性脑膜炎是否会有后遗症，要根据具体病情以及恢复情况决定。
如果病情较轻微，临床表现症状较轻，介入治疗比较及时，通过积极系统的抗病毒治疗后，完全可以痊愈，不会留有后遗症。
如果患有无菌性脑膜炎病情严重，临床表现症状明显。说明病毒感染已经严重危害到了大脑中枢，而且对大脑神经中枢的损伤多数是不可逆转的。这种情况下多数会留有比较严重的后遗症，例如肢体运动功能障碍或者神经系统的损伤等。