首先，二者的传播方式有一些区别。诺如病毒可以通过被污染的水源、食品、接触患者使用过的物品以及呼吸道进行传播，而轮状病毒最主要的传播方式为粪-口传播。
其次，二者的易感人群也有所不同。诺如病毒感染并无年龄之分，无论是儿童或成人，均有可能会感染此病。而轮状病毒的重点侵袭对象是婴幼儿。
另外，二者的主要临床症状也存在差异性。比如，诺如病毒的患者，其粪便没有明显的特异性，而轮状病毒腹泻的患者，可出现典型的蛋花汤样粪便。
最后，二者的发病时间也存在一定的区别。诺如病毒虽然一年四季都可以发病，不过以寒冷季节最为高发。而轮状病毒，最常好发于夏季和秋季。