马方综合征本身一般不会引起偏头痛现象发生。这是因为马方综合征是一种和遗传相关的结缔组织发育不良疾病。
马方综合征主要影响的是心血管系统以及骨骼系统和眼底等，导致相应的疾病发生，比如引起心力衰竭或者视力丧失，这些情况都不会引起偏头痛的发生。此外，少数马方综合征有可能合并蛛网膜下腔囊肿改变，囊肿较大的情况下或者囊肿破裂，有可能引起头痛症状发生，但这种头痛和偏头痛没有关系。
偏头痛的发病原因，目前认为和遗传以及内分泌紊乱，以及代谢的改变有关系，并且好发于女性患者。