肥厚性心肌病可以进行手术治疗。这种情况主要适用于严重的心室壁肥厚或者伴有流出道梗阻的患者，手术方式有两种：
第一，就是介入治疗，也就是微创治疗，通过对心脏内的某些血管进行堵塞造成心肌的缺血性坏死，或者注射无水酒精造成局部的心肌坏死，从而减轻心脏肥厚导致的心脏舒张功能异常。
第二，就是外科手术治疗，通过外科手术可以切除部分肥厚的心肌，解除肥厚心肌的舒张功能异常，解除流出道的梗阻，从而改善心脏的舒张功能，预防严重的并发症发生。