脓毒症的治疗时间个体差异较大，与脓毒症病原微生物种类情况，患者一般状态，合并脏器损伤等多种因素相关。
如果患者一般状态良好，不合并严重脏器功能衰竭等并发症。同时，在临床上存在敏感抗感染药物，则在治疗上以全身抗感染治疗为主，大部分患者可在2周好转。
但如果患者一般状态较差，存在休克、意识障碍等严重临床症状，或者已合并肝肾功能损伤等并发症，治疗时间相对较长，大部分患者治疗持续1个月以上，部分严重患者存在一定死亡概率。