根据肾脏的功能以及双重肾脏、双重输尿管所表现出来的症状，可采用传统的开放手术及腹腔镜下手术来进行处理。
1.上半肾的功能良好，但是出现泌尿系统的梗阻或者反复发作的泌尿系统的感染等表现，伴有输尿管反流的可行输尿管膀胱吻合术，无输尿管反流的可行输尿管肾盂吻合术。
2.上半肾功能丧失、上段输尿管迂曲扩张、输尿管开口位置异常引起尿路梗阻、感染等表现，需行上半肾及上段输尿管切除术。
大多数的输尿管膨出及异位开口都来源于上半肾，所以在切除上半肾及上段输尿管后输尿管膨出及异位开口会自行萎缩。