精子质量差、畸形率高，通常可以在医师指导下应用激素类药物，例如睾丸酮治疗，治疗后可以促进精子正常发育，能有效地提高精子质量。
另外，如果是由于前列腺炎睾丸炎等生殖系统炎症引起的精子质量差、畸形率高，还需要运用治疗这些疾病的药物，例如可以运用头孢替安，头孢氨苄抗炎治疗。
其次，在饮食方面建议多进食一些含有优质蛋白质和维生素C、维生素E的食物，例如牛羊肉和生蚝，这类食物可以提供给精子发育所需要的营养物质，促进精子正常发育。