小儿尿路感染首先到医院做尿常规检查明确诊断，然后在医生的指导下服用针对性强、血药浓度高、以尿液排泄为主、尿液中药浓度高的消炎药。
小儿还应特别选用药物的毒副作用少，对生长发育不影响的消炎药物来进行治疗，比如选用氨苄青霉素、头孢菌素类等，然后观察治疗的效果如何，如果治疗的效果比较好，就说明使用的抗生素药物覆盖该病原菌。
如果治疗的效果不理想，就需要根据尿细菌培养以及药敏实验结果，选择敏感度高的抗生素药物来进行治疗，这样才能达到比较好的治疗效果。一般规范治疗一周左右，小儿尿路感染的症状就会缓解，病情能够痊愈。