月经12天不来不一定算怀孕。不能根据女性月经推迟就确定是怀孕，导致月经推迟的原因有很多，可能的原因有：
1.平时月经规律的女性月经推迟12天，如果有性生活史，并且没有避孕，应该考虑怀孕的可能性。可以进行血检和尿检HCG判断是否怀孕，也可以进行阴道超声检查，看宫腔内是否有妊娠囊，确定是否是宫内孕。
2.女性出现卵巢早衰、高泌乳素血症、多囊卵巢综合征、甲状腺功能低下等情况下，都可能导致月经推迟。可以通过检查性激素六项和甲状腺功能协助诊断。
3.女性近期做过人流或者刮宫手术，也可能由于子宫内膜损伤，或宫腔粘连、宫颈粘连导致月经推迟。