绝大多数的舌下腺囊肿患者需要进行手术治疗，只有个别舌下腺囊肿可以选择非手术治疗的方法。这部分患者往往有自身身体情况，或者心理方面的特殊情况，才选择非手术治疗。
目前公认的最佳的舌下腺囊肿治疗方法是舌下腺摘除术，这种方法治疗效果比较确切。摘除以后，舌下腺没有了，分泌液也没有了，囊肿极少出现复发。如果患者的身体情况很差，不能耐受手术治疗或者患者因为心理的问题，而不接受手术治疗，可以尝试非手术治疗，比如局部药物注射、硬化剂治疗，还可以尝试激光治疗。这些方法是可以尝试的，对特殊人群可以应用。但是因为有效率不是很高，有相当一部分患者在经过保守治疗以后，症状仍然不能缓解，然后再转而进行手术治疗。
所以，选择非手术治疗的时候，一定要跟患者交代清楚，可能有效率有限，在反复治疗没有效果的时候要进行手术治疗。