形成肛裂的原因最主要的就是便秘，患者大便干燥，便线粗而硬，在用力排便的过程中就有可能将肛管皮肤全层撑裂而至肛裂的形成。
另外肛裂的形成原因还包括内括约肌痉挛，当内括约肌痉挛时，就会造成肛管内的压力增高肛门舒展性不够，而至肛裂产生，而导致肛门内括约肌痉挛的原因包括炎症刺激、酸性粪便的刺激、括约肌外露或者情绪异常等等。
还有缺血，缺血也是形成肛裂的主要原因之一。
最后一个原因是解剖结构，由于肛门外括约肌在肛管前后形成两个裂隙，对肛管缺乏足够的支撑，所以容易导致产生肛裂。