脑萎缩是有可能会引起吞咽功能障碍的，一般情况下脑萎缩主要是包括大脑萎缩和小脑萎缩。
引起脑萎缩的主要的原因包括遗传因素、脑外伤、脑出血、脑组织缺血缺氧性病变、大量的饮酒及不良的生活习惯等。通常情况下大脑萎缩以及小脑萎缩会导致患者出现头疼、头晕、肢体乏力、精神不振、注意力下降、记忆力减退等，通常不会影响吞咽功能。
脑萎缩除非影响到脑干导致脑干出现萎缩，影响到迷走神经、舌咽神经及舌下神经及核团，患者往往可能会出现吞咽困难、饮水呛咳、声音嘶哑等症状出现。因此脑萎缩可能会影响吞咽功能。