小肠损伤根据发病原因不同、损伤的轻重程度不同，相应的临床表现也不一样。
轻度的损伤，如肠壁挫伤和血肿，初期表现可有轻度或局限性腹膜刺激症状，腹痛程度可忍。随着血肿的吸收和挫伤炎症的修复，腹部体征可以消失，但也可因病情加重而出现肠壁坏死、穿孔，这时候腹痛的程度就会很剧烈，需要给予止痛药物治疗，并立即手术。
损伤较重的肠破裂、穿孔时肠内容物外溢，腹膜受消化液的刺激，患者可表现为剧烈的腹痛，可有全腹压痛、反跳痛、腹肌紧张，随着时间的推移，感染中毒症状加重。