输尿管结石可以是原发性的，也可以是继发性的，其中以继发性的结石为主要部分。
输尿管上端连接肾盂，下端连接膀胱，所以输尿管结石主要是继发于肾结石，结石一般主要在肾脏形成，排至输尿管后即可形成输尿管结石。
原发性的输尿管结石，主要是继发于结石以下部位有梗阻性疾病，比如输尿管肿瘤、输尿管炎性息肉等。当出现梗阻后，会导致肾及梗阻以上的部位等输尿管积水，尿液中的代谢物质在输尿管内沉积，可形成结石。
输尿管结石一旦发生，应该及时治疗，否则容易影响肾脏的功能。