腹腔镜小肠异物取出术具有手术创伤小、恢复快等优点。但也会出现所有腹腔镜手术引起的并发症，如与传统手术相同的并发症如出血等。.与气腹有关的并发症，膈肌抬高、肺顺应性下降、有效通气减少，从而影响心肺功能，如皮下气肿、气胸、心包积气、气体栓塞。与操作有关，术中血管损伤、术中内脏损伤、腹壁并发症如戳孔等。
若既往腹部有手术史，小肠异物引起小肠穿孔，合并腹腔感染、心血管系统疾病时不能行腹腔镜手术，可考虑肠镜或直接开腹取出。