半夜出现咳嗽的症状，咳嗽变异性哮喘的可能性较大，特别是吸入刺鼻气味时症状会加重。治疗方法和普通哮喘相似，可以给予抗过敏药物，比如氯雷他定。另外，可以应用糖皮质激素，比如布地奈德，以此减轻气道的慢性炎症和痉挛。还需要搭配一些支气管扩张剂，比如特布他林、沙丁胺醇或者茶碱缓释片。
心功能不全者，也会由于肺淤血引起半夜咳嗽，需要积极治疗心功能不全，比如给予呋塞米、硝酸甘油等利尿、扩血管药物。心衰得以控制后，咳嗽方能自行缓解。
半夜咳嗽也不排除是胃食管反流病导致，可以应用奥美拉唑、硫糖铝、多潘立酮等药物进行抑酸、保护胃黏膜以及促进胃动力治疗，咳嗽才能从根本上解决。