在临床上治疗慢性睾丸炎，需要针对病因进行系统的治疗。非特异性慢性睾丸炎主要是对症支持治疗，如局部的物理治疗。热敷对于疼痛明显的患者，可以精索封闭。热疗等以促进慢性炎症的吸收，同时可以口服广谱的抗菌药物。
就目前来看一般的情况，认为该病具有自限性，但是需要数年甚至是数十年才能治愈。仅对于其他治疗。无法控制疼痛的病例，才需要做睾丸切除术。有些病治甚至术后也无法减轻疼痛。睾丸萎缩的做睾丸切除并进行，病理检查。