一部分胆道镜检查的患者可能会出现腹痛、腹胀、恶心呕吐等不舒服的症状，但具体情况因人而异一般情况下不会引起明显的临床症状，且绝大部分患者都可以耐受。
目前胆道镜检查分两种：
一是术中纤维胆道镜；
二是经T形管窦道纤维胆道镜检查；
前者由于是在术中全身麻醉下进行，因此患者不会有感觉术后有可能出现腹痛、腹胀、恶心呕吐等情况一般情况下给予对症处理即可。后者采用窦道内和胆道内局部表面麻醉，用2%利多卡因5～10ml，加0.1%肾上腺素0.1ml，患者在这个过程中可以感觉得到，因此出现不适的概率更高但多能耐受。