门静脉高压症的处理方式，与患者的疾病临床表现，以及原发疾病有很大关系。
如果是肝硬化引起门静脉高压，并且有出现脾脏肿大，有食管胃底静脉曲张等临床表现时，需要引起重视，避免出现消化道出血以及脾破裂出血。因此，需要给患者使用降低门静脉高压的药物，有可能需要给患者使用血管加压素，促进内脏动脉的收缩，或者是口服普萘洛尔；必要的时候有可能需要进行手术治疗，可以选择性地分流。
如果已经出现食管胃底静脉曲张破裂出血，应该要及时地给予输血止血、抗休克治疗。