软腭瘫痪单纯使用药膏治疗作用有限。临床上常用的药物包括营养神经的药物，例如维生素B1、维生素B12及其衍生物甲钴胺、腺苷钴胺等，其它的药物包括抗胆碱药加兰他敏等。
软腭瘫痪在临床当中分为中枢性的瘫痪和周围性的瘫痪。中枢性瘫痪的病因包括脑出血、脑梗死、脑肿瘤、脑外伤等。周围性瘫痪，主要为神经根神经炎。
当发作时，首先应对原发病进行治疗。其次，主要是给予康复治疗，包括低频电电刺激或冰刺激等。还可以配合针灸治疗，也有很好的效果。