饮水呛咳可能为脑梗所引起。在脑梗塞时可能损害了脑干的舌咽神经，就会导致患者出现吞咽困难、饮水呛咳的症状。
在恢复期患者应当进行吞咽功能训练，使用针灸疗法刺激咽喉部位的肌肉，促进吞咽功能的恢复，还可对咽喉部位的肌肉进行生物反馈治疗。如果吞咽困难、饮水呛咳的症状仍然得不到缓解，应当留置鼻饲管，给予鼻饲饮食，防止因为呛咳而引发吸入性肺炎。
患者的吞咽功能在恢复的过程当中，饮食应当由软到硬，由少到多。只要坚持康复治疗，吞咽功能会逐渐好转。