早上醒来肚子痛、拉肚子可能是睡觉时受凉或者是饮食因素的影响、消化系统方面的疾病引起的。
夏天天气炎热、晚上开空调睡觉、不注意保暖，导致腹部受凉、肠蠕动加快，早上起床后会肚子疼、拉肚子。早上起床后拉肚子，可能受到晚上饮食的影响。比如摄入腐败变质的食物，引起急性肠胃炎，导致肚子疼、拉肚子。排除以上因素，也可考虑胃炎、肠炎、食物吸收消化不良、肠道菌群失调，也可能导致腹部疼痛、腹泻。
建议进行胃肠镜、幽门螺旋杆菌检测，在医生指导下给予药物治疗。