肛门处伤口位置特殊、愈合时间较长，促进伤口愈合的药主要有重组表皮生长因子、壳聚糖等。这些药物可以减少炎症细胞渗出、促进伤口新生肉芽组织、缩短创面的愈合时间、抑制伤口骨性胶原的产生、减少伤口愈合中瘢痕的形成，有利于伤口的愈合。
肛门伤口愈合还会受多种因素影响，如出现了炎症、粪便刺激等，促进伤口愈合的药物，还可以用生肌玉红膏、痔疮膏等。坐浴的药物有高锰酸钾和自配中草药，有时还需要应用抗生素类药物。出现了水肿，还要应用减轻水肿的药物，地奥司明片或迈之灵，每次伤口换药还要应用碘伏等消毒药物。
为了促进肛门伤口愈合，平时要保持肛门周围清洁、干燥和卫生，便后清洗干净肛门，并进行坐浴、防止感染。